Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CNGA3Q16281 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNGA3Q16281 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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