Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NPTX1Q15818 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPTX1Q15818 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms