Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CDSNQ15517 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDSNQ15517 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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CDSNQ15517 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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CDSNQ15517 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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