Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NR6A1Q15406 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms