Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBE3CQ15386 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBE3CQ15386 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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