Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDGFRLQ15198 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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