Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDK1Q15118 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDK1Q15118 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms