Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RAB39AQ14964 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms