Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CHD4Q14839 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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CHD4Q14839 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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CHD4Q14839 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHD4Q14839 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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