Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
BECN1Q14457 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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