Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PDE1CQ14123 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PDE1CQ14123 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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