Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNTB1Q13884 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms