Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
PTCH1Q13635 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTCH1Q13635 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
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