Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CUL4AQ13619 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CUL4AQ13619 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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