Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PPP1R1AQ13522 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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