Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GPM6BQ13491 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms