Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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ITGB3BPQ13352 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ITGB3BPQ13352 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
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