Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
PRDM2Q13029 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PRDM2Q13029 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
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