Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPRL3Q12980 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms