Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PTP4A2Q12974 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms