Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXO1Q12778 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FOXO1Q12778 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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FOXO1Q12778 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXO1Q12778 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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