Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOBRQ0VD83 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOBRQ0VD83 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms