Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNB2Q08289 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms