Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TGM3Q08188 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TGM3Q08188 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms