Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCL9Q07325 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CXCL9Q07325 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms