Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FMODQ06828 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FMODQ06828 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms