Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC18A2Q05940 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms