Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CHRNEQ04844 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124 ms