Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SSBP1Q04837 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SSBP1Q04837 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms