Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACVR1Q04771 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ACVR1Q04771 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms