Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX2Q04743 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms