Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
IRF8Q02556 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
IRF8Q02556 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms