Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
FANCCQ00597 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms