Protein–RNA interactions for Protein: P78539

SRPX, Sushi repeat-containing protein SRPX, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPXP78539 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRPXP78539 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRPXP78539 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRPXP78539 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRPXP78539 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SRPXP78539 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SRPXP78539 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms