Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CSNK2A1P68400 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CSNK2A1P68400 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms