Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms