Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERVFRD-1P60508 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms