Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GFRA1P56159 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms