Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AFDNP55196 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFDNP55196 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFDNP55196 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
AFDNP55196 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
AFDNP55196 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms