Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CRISP1P54107 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms