Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
COPAP53621 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
COPAP53621 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
COPAP53621 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
COPAP53621 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
COPAP53621 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms