Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BRCA2P51587 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms