Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIP4K2AP48426 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms