Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLR2IP36954 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms