Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM23P36406 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms