Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RORAP35398 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RORAP35398 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RORAP35398 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms