Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFC4P35249 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms