Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ABCC1P33527 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ABCC1P33527 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms