Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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CASQ1P31415 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CASQ1P31415 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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