Protein–RNA interactions for Protein: P31274

HOXC9, Homeobox protein Hox-C9, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC9P31274 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC9P31274 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC9P31274 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms